Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CABP7Q86V35 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms