Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
YTHDF3Q7Z739 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms