Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms