Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD6Q6ZV73 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD6Q6ZV73 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms