Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM43BQ6ZT52 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM43BQ6ZT52 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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