Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC9Q6ZRR7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms