Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAF7Q6Q0C0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF7Q6Q0C0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms