Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REEP3Q6NUK4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REEP3Q6NUK4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms