Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SAMD13Q5VXD3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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