Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GARNL3Q5VVW2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms