Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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TMEM78Q5T7P6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMEM78Q5T7P6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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