Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATAD3CQ5T2N8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms