Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PCID2Q5JVF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCID2Q5JVF3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms