Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL39P5Q59GN2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL39P5Q59GN2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms