Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SDK2Q58EX2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms