Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TDRD12Q587J7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms