Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC93Q567U6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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