Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ANKRD39Q53RE8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms