Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGSM1Q2NKQ1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms