Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC142Q17RM4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC142Q17RM4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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