Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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TXNRD1Q16881 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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TXNRD1Q16881 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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TXNRD1Q16881 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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TXNRD1Q16881 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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TXNRD1Q16881 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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TXNRD1Q16881 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TXNRD1Q16881 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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