Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UPP1Q16831 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPP1Q16831 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPP1Q16831 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms