Protein–RNA interactions for Protein: Q16829

DUSP7, Dual specificity protein phosphatase 7, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP7Q16829 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP7Q16829 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms