Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HIST3H3Q16695 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms