Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN3Q16667 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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