Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP7Q16576 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP7Q16576 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms