Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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GABRA6Q16445 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA6Q16445 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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