Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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EXT1Q16394 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
EXT1Q16394 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EXT1Q16394 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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