Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDSNQ15517 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CDSNQ15517 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDSNQ15517 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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