Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERBB4Q15303 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERBB4Q15303 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms