Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCF4Q15080 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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