Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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