Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHPRHQ149N8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
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