Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSPNQ14714 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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