Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT33BQ14525 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT33BQ14525 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT33BQ14525 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT33BQ14525 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT33BQ14525 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRT33BQ14525 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRT33BQ14525 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms