Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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