Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ERV3-1Q14264 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms