Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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