Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RASGRF1Q13972 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RASGRF1Q13972 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms