Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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ITGA9Q13797 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA9Q13797 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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