Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
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