Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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C1orf61Q13536 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C1orf61Q13536 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms