Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF6Q13247 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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