Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SRSF5Q13243 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF5Q13243 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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