Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EGR3Q06889 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms