Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CD164Q04900 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms