Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KCNC4Q03721 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNC4Q03721 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms