Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFITM3Q01628 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms