Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DEFA6Q01524 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms