Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1BQ00975 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms